| 開催期間 | 1999年7月30日（金）31日（土）8月1日（日） |
|---|---|
| 開催場所 | 新潟県・苗場スキー場 |
| 動員数 | 72,000人 |
この年は、会場を新潟県苗場スキー場一帯の広大な敷地に移された最初の年！3日間の開催となりました。
グリーンステージ、ホワイトステージ、フィールドオブヘブン、ダンステント、ニューカマーステージが自然の地形を生かした各所に配され、各々ちがった“空気感”をともなったライブを同時進行させるという初の試みに、7万人を超える観客と100をこえるアーティストが、ライブの歓喜を分かち合いました。
特筆すべきは、300人の若者ボランティアによって行われた、ゴミの自己管理キャンペーン。この小さな試みが'、99年のFuji Rock Festivalが海外のメディアを通じて「クリーンフェス」と大きく報道された由縁であり、そして、音楽を愛するお客さんやアーティスト、スタッフ皆で作るフェスティバルの基盤となったのです。
| GREEN STAGE | ||
| ROCKET FROM THE CRYPT | Rory Mcleod | FEMI KUTI |
| PHISH | 東京スカパラダイスオーケストラ | CATATONIA |
| 奥田民生 | BOREDOMS | ASH |
| STEVIE SALAS | UA | ラフィータフィ-忌野清志郎 |
| NAWANG KECHOG | RAY DAVIES | OCEAN COLOUR SCENE |
| Hi-STANDARD | SKUNK ANANSIE | BERNARD BUTLER |
| THE BLACK CROWES | LIMP BIZKIT | NAWANG KECHOG |
| RAGE AGAINST THE MACHINE | THE CHEMICAL BROTHERS | JOE STRUMMER and The Mescaleros |
| TODOS TUS MUERTOS | BLUR | ZZ TOP |
| --- | --- | TODOS TUS MUERTOS |
| WHITE STAGE | ||
| 電撃ネットワーク | DMBQ | POLYSICS |
| NEVE | BRAHMAN | MISHKA |
| REGULAR FRIES | FEEDER | FOUNTAINS OF WAYNE |
| DEATH IN VEGAS | BACK DROP BOMB | FUN LOVIN' CRIMINALS |
| audio active | eastern youth | LEE "SCRATCH" PERRY |
| PROPELLERHEADS | ATARI TEENAGE RIOT | TRICKY |
| UNDERWORLD | THE JON SPENCER BLUES EXPLOSION | HAPPY MONDAYS |
| FIELD OF HEAVEN | ||
| Osamu Koganei | Hiroki Okano with Tenkoo Orchestra | RORY McLEOD |
| RORY McLEOD | Rory McLeod | BREAKBEAT ERA |
| BIG FROG | NAWANG KHECHOG with THE 3PEACE | TODOS TUS MUERTOS |
| Ruby | TODOS TUS MUERTOS | FEMI KUTI |
| PHISH | PHISH | PHISH |
| Virgin TENT "PLANET GROOVE" | ||
| MAMEZUKA | DJ ALEX | DRY AND HEAVY (Live) |
| サイケアウツ(Live) | SUSUMU YOKOTA | MANI (from Primal Scream) |
| RHYTHM FREAKS | DJ YAMA | GAZ'S ROCKIN' BLUES featuring SKA FLAMES (Live) |
| DUB SQUAD(Live) | HYBRID (Live) | KURANAKA+1945 |
| DEEJAY PUNK-ROC | KIHIRA NAOKI | 流-RYU-(DJ KRUSH , DJ HIDE ,DJ SAK ) with TUNDE AYANYEMI |
| DJ KENSEI | Q'HEY | RONI SIZE ＆ DYNAMITE MC |
| DJ YAS | DJ SHUFFLE MASTER | BREAKBEAT ERA (Live) |
| TWIGY featuring RINO DJ AMEKEN and DJ YUZE (Live) | TSUYOSHI ～ JouJouka (Live) | DJ DIE |
| MIX MASTER MIKE | SUSUMU YOKOTA | Jungle Brothers (Live) |
| Prince Paul ＆ Automator | dj wada | MAD PROFESSOR |
| DJ TOUCHE from WISEGUYS | The Orb (Live) | TATSUYUKI HIYAMUTA PRESENTS ”仁義なき戦い”In TABOO |
| LES RYTHMES DIGITALES (Live) | CAPTAIN FUNK | --- |
| Jon Carter(from Monkey mafia) | co-fusion | --- |
| BOOM BOOM SATELLITES (Live) | UNDERWATER NIGHT featuring DARREN EMERSON , DARREN PRICE | --- |
| SHINICHIRO HIRATA | KEN ISHII | --- |
| --- | DJ Spooky That Subliminal Kid | --- |
| Levi's NEW STAGE | ||
| Missile Girl Scoot | ネコグルマ | THE BACK HORN |
| MUSCLE DOGGY GROOVES | In the Soup | STROBO |
| Dr.Core (from Korea) | PEALOUT | the cimons |
| MAD 3 | くるり | WINO |
